测序里barcode是啥?帮你标记样本的小标签


在测序过程中,barcode(条形码)是一种非常重要的工具,用于标记和区分不同的样本。简单来说,barcode就像是给每个样本一个独特的身份标签,这样在测序结束后,我们就能准确知道每个测序读段(read)来自于哪个原始样本。

通常,barcode是一段短的、特定的核酸序列,比如一段DNA序列,它会被添加到每个样本的RNA或DNA分子上。在多组学测序中,尤其是单细胞测序,由于每个细胞或分子的数量非常庞大,使用barcode可以有效地避免样本之间的交叉污染,确保数据的准确性和可追溯性。

例如,在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中,每个单细胞的RNA分子都会被随机地添加一个独特的barcode,然后与一个公共的转录组库混合进行测序。通过后续的生物信息学分析,我们可以根据barcode将测序读段分配回各自的细胞,从而得到每个细胞的基因表达信息。

总之,barcode在测序中扮演着至关重要的角色,它不仅帮助研究人员精确地识别和分离不同样本的测序数据,还大大提高了测序的效率和准确性。没有barcode,复杂的测序实验将难以进行,也无法获得可靠的实验结果。